进入21世纪以来，中国高等教育已进入“大众化教育”阶段，最终将进入“高等教育普及化”阶段，也为中国大学评价指标体系带来的新的问题，存在众多理论问题尚待解决。

21世纪的中国大学评价不能固执于上个世纪的评价思想，要顺应时代发展要求、符合教育适应经济、社会发展规律，广泛地听取社会各界的意见和建议。目前对中国高校的办学评价不再是简单的学生数量、SCI、EI或其他数据库的论文和专利数量等规模指标的比较，评价者要紧跟时代步伐、不断创新与学习，正确认识人才培养和科学研究的关系；正确认识不同类型、不同层次院校的办学差异和发展定位，处理好办学规模指标和质量指标的关系；充分认识“育人是教育的根本任务”的深刻内涵，认识不同类型人才的社会贡献和评价标准…。